Variable selection for genome-wide association studies with known genealogy

A. Quirós, C. Armero, S. Cabras, M. E. Castellanos

Genome-wide association studies assess relationships between single nucleotide polymorphisms (SNP) and diseases. They are popular problems in genetics in which the number of SNP is large compared to the number of subjects in the study. Individuals might not be independent, especially in animal breeding studies or genetic diseases in isolated populations. We propose a family-based model in a two-stage approach comprising a dimension reduction and a subsequent model selection. The first stage, in which the genetic relatedness between the subjects is taken into account, selects the promising SNP. The second stage uses Bayes factors for comparing among all candidate models and a random search strategy for exploring the space of all the regression models in a fully Bayesian approach. We illustrate its performance, and compare with existing methods like Bayesian lasso or GEMMA, in a simulated study and in a real study about Beta-thalassemia disorder in an isolated population from Sardinia.

Palabras clave / Keywords: Bayes factor, kinship, model selection

Programado

Sesión GT08-2 Inferencia Bayesiana-2: Genomics and Spatial statistics under a Bayesian perspective (BAYES-2). Organizador: Stefano Cabras
29 de mayo de 2018 17:00
Sala 1

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Certificados
Están disponibles en el área privada los certificados de asistencia, de presentación de trabajo y de moderación de sesión.
13/04/18
Resumen del programa y Programa detallado
En este enlace puedes encontrar un enlace al Resumen del Programa para el Congreso SEIO y las Jornadas de Estadística Pública 2018, y a partir de él (o directamente aquí) el Programa Científico detallado.
22/03/18
Descuentos en medios de trasporte para congresistas y acompañantes
La organización del XXXVII Congreso de la Sociedad de Estadística e Investigación Operativa y de las XI Jornadas de Estadística Pública está tratando de facilitar en parte el desplazamiento durante las fechas de celebración de ambos encuentros. Para ello, estamos negociando con algunas de las empresas que realizan los servicios de transporte de pasajeros entre el Principado de Asturias y el resto de España con la finalidad de que podamos ofreceros un descuento sobre el coste del viaje en esos medios. Mediante este mensaje nos es grato comunicarte que, a día de hoy, hay un acuerdo para conseguir un 15% de descuento si el desplazamiento lo vas a realizar en autobús y un 30% de descuento si lo vas a realizar en trenes de alta velocidad o larga distancia. Los detalles están disponibles en el menú "Medios de transporte" que aparece en el área privada.
01/02/18
Ampliación del plazo de tarifa superreducida
Se ha ampliado el plazo de inscripción con tarifa superreducida: hasta el 28 de febrero.
19/01/18
Ampliación de plazos
Se han ampliado los plazos para el envío de propuestas de sesiones invitadas (hasta el 10 de febrero) y de abstracts (hasta el 25 de febrero) para el Congreso SEIO'2018.
15/01/18
Programación para el día 29 de mayo
El día 29 de mayo va a estar exclusivamente dedicado a la celebración de las reuniones (sin ponencias) y sesiones (con ponencias) de los Grupos de Trabajo SEIO, y a las exposiciones de los candidatos de la actual convocatoria del Premio Ramiro Melendreras. La hora de inicio del Programa de ese día se fijará en función del número de sesiones, del número de candidatos al premio y de lograr una distribución de actividades lo más oportuna posible.
15/01/18
Conferenciantes plenarios
Conferenciantes plenarios de Estadística, Investigación Operativa y Estadística Pública.
12/01/18
Sede: Palacio de Congresos
La sede será el Palacio de Exposiciones y Congresos Ciudad de Oviedo. Enlace para el plano detallado
24/12/17
Sesión plenaria en memoria del Profesor Pedro Gil
El Comité Organizador quiere aprovechar la oportunidad de que el Congreso SEIO se celebre en esta edición en Asturias para dedicar una sesión plenaria en memoria del Profesor Pedro Gil, creador del Departamento de Estadística e Investigación Operativa y Didáctica de la Matemática de la Universidad de Oviedo, impulsor de los estudios de Matemáticas en dicha Universidad y Presidente de la SEIO. Es previsible que esta sesión se desarrolle en la mañana del día 1 de junio, y resulta una ocasión excepcional para poder reunir a su Sociedad y a su Universidad.
24/12/17
Corrección bases del Premio Ramiro Melendreras
El Comité Científico del Congreso SEIO’2018 junto con el Consejo Ejecutivo de la SEIO han acordado que aunque no exista un criterio plenamente neutral y satisfactorio parece conveniente (con el fin de que los candidatos sepan con tiempo a qué atenerse) aplicar la recomendación que se daba en el Punto 1.7 del Manual de instrucciones para la organización de los congresos nacionales de Estadística e Investigación Operativa y de las Jornadas de Estadística Pública (http://www.seio.es/descargas/manualCongresosSEIO.pdf), según la cual esa fecha límite inferior correspondería al 1 de enero de 30 años menos que el año en el que se celebra la edición correspondiente. De este modo, en el Congreso SEIO’2018, la Base 1 queda (1. Podrán participar en la convocatoria del premio todos los candidatos nacidos en el año 1988 o posteriores).

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